V apríli 1944 začal Adolf Eichmann so svojím malým tímom nútiť a deportovať maďarské židovstvo do geta – s aktívnou maďarskou pomocou, to znamenalo, že s pomocou cca. 200 000 ľudí (žandári, štátny zamestnaneci a železničiari).
Trikrát deportovali z Baji: 14. apríla bolo unesených 150 ľudí, veľká deportácia sa uskutočnila koncom mája, čo znamenalo 640 ľudí, pripadol na nedeľu (28. mája), posledná deportácia uskutočnila sa v polovici júna. Židia z Baja odišli do Gaensendorfu a potom boli deportovaní do Osvienčimu, odkiaľ iba 19 sa vrátili, ostatných zavraždili. Podľa údajov o deportáciách je zložený pre 1400 obetí pamätník, a vrátilo sa 400 preživších - väčšina z nich v Rakúsku prežil vojnu.