Adolf Eichmann s hrstkou pomahačů v dubnu 1944 začali s vyháněním maďarských židů do ghett a s jejich deportacemi, s aktivní pomocí cca 200 000 Maďarů (včetně četnictva, státních úředníků a železničářů).
Deportace z Baji proběhly ve třech termínech: 150 lidí bylo odvezeno 14. dubna, pak většina, tedy nějakých 640 lidí o letnicích (28. května), a poslední židé odjeli uprostřed června. Židé z Baji byli nejprve deportováni do Gänserndorfu a poté do Osvětimi. Pouhých 19 z nich se vrátilo, všichni ostatní byli zavražděni. Podle údajů o deportacích byl postaven památník 1400 obětem z Baji, vrátilo se cca 400 deportovaných židů, většina z nich se dočkala konce války v pracovních táborech v Rakousku.