Adolf Eichmann i jego niewielki zespół przystąpił do organizowania gett i deportacji węgierskich Żydów w kwietniu 1944 roku, wykorzystując aktywną pomoc około 200 000 Węgrów (w tym żandarmerii, urzędników państwowych i kolejarzy).
Deportację z Baja przeprowadzono w trzech terminach: 14 kwietnia wywieziono 150 osób, większość, około 640 w Zielone Świątki (28 maja), a ostatni dzień deportacji przypadł na połowę czerwca. Żydów z Baja deportowano najpierw do obozu w Gänserndorf, a następnie do Auschwitz. Spośród tych, których deportowano do Auschwitz, powróciło tylko 19 osób, wszystkich pozostałych zamordowano. Ku czci 1400 ofiar z Baja, zgodnie z danymi, postawiono pomnik. Z deportacji powróciło 400 osób, większość z nich doczekała końca wojny w austriackich obozach pracy.